柯南和小五郎等(děng )拉着(zhe )大队,来到位于太平洋中的美丽小岛“神海岛”渡假。这座岛屿自古已(yǐ )有流传,大概有关沉没于海底的古代遗迹“海底宫殿”,及300年前两(liǎng )名女海盗遗留下来的宝藏传说。小兰和园子不惧(jù )流传,在“海底(dǐ )宫殿”附近潜水时,意外遇到一大(dà )群正在寻找宝物的(de )猎人,不料其中一人突然遭鲨鱼攻击,不幸(xìng )身亡!小兰和园子幸运逃难,柯南见那位猎人死状诡异,与灰原一起展开调查。
柯南认为猎(liè )人之死,跟宝藏传说有着莫大关系,他试图解开背(bèi )后原因,“海底宫殿”的谜题一直系绕在他的脑海中。他找到了一组神秘名词“Jolly Roger(海盗旗)”后,满以为有所起色,猎人却突然现身,并偷走了原来发现的(de )宝藏!小兰和园子落在猎人的(de )魔(mó )掌之中,性命危在旦夕!隐藏于传说中的讯息是什么?“海底宫殿(diàn )”有什么秘密?穿越300年时光的暗(àn )号,柯南誓要逐步解开迷题