2285年,在(zài )与可汗的战斗(dòu )中损坏的联邦星舰进取号,返回了地球的太空港以进行维修。柯克还在为斯波克的死感到悲伤(shāng )。麦科伊医生(shēng )出现了种种异常的行为:如擅自闯入被封锁(suǒ )的斯波克原(yuán )来(lái )的舱房、胡言乱语等(děng ),最后他被送进了医院进行精神检查(chá )。斯科提被另分派到(dào )了联邦(bāng )星舰精(jīng )进号。星际舰队指挥部 对新形成的创世星下达了禁入令。柯克被告知,进取(qǔ )号即将除役。
斯波克的(de )父亲沙瑞克找到柯克并告诉他,斯波克的遗体必须返回瓦肯星(xīng ),否则他的灵魂就不得安息。沙瑞克要求柯克必须回到创世星(xīng ),寻回斯波克的遗棺(guān )并将它带回瓦肯星——而斯波克临死前与麦科伊进行了心灵融合,因此带有斯波克灵魂的麦科伊也必须前往瓦肯星。
可是,星际舰队拒绝让陈旧的进取号离开太空港。从医院出来后听闻消息的麦科伊,企图招募一艘飞船回到创世星。在与人争吵时他被逮捕,但这并没有影响到整个计划:在柯克、斯科特、苏鲁、乌乎拉和切科夫的(de )帮.