西元1999年,一顆不明(míng )的巨大「流星」墜落在地球上。之後調查證實這其實是一艘外星人的宇宙船(chuán ),之後世界的某些強國為了將其修復(fù )並(bìng )彌補墜落時對地球環境所造成的破壞(還得掩蓋掉(diào )這個外星船墜落的事實),而組成了統合政府。並由地球統合(hé )軍將其改造成為全長1200公尺的超大型主力戰艦,命名為「馬克羅斯」(MACROSS,德文「大(dà )宇宙」之意)。其間人類卻也歷經統合派與反統合派國家陣營的分裂,在綿延的爭戰中馬克羅斯(sī )的改修則(zé )仍然持續著。直到10年後,在馬克羅斯舉(jǔ )行正式起用下水典禮的當天,在月球軌道附近突然發現有大規模的時空跳躍反應。而此時馬客羅斯艦上的主炮竟自動發射,並擊中(zhōng )在月球出現(xiàn )的外星艦隊觀測艦!事已(yǐ )至如此(cǐ )頓時成(chéng )了(le )趕鴨子上架,不把對方惹毛才是怪事……於是統合軍只好展開接戰,並讓馬克羅斯升空啟航,以轉移敵方注意。青年一條輝陰錯陽差的坐上了統合軍的戰機捲入(rù )戰鬥,並救起了一位名(míng )叫林明美的(de )少女,且與艦上女軍官(guān )早賴未沙的不吵不相識……被稱為「第一次宇宙大戰」的這場(chǎng )人類對異星人的戰爭就此揭開了序幕。而圍繞在輝、明美與未沙之間的感情糾葛,卻也開始介入了戰事的發展(zhǎn )之(zhī )中,甚而(ér )成為主導後來歷史走向的契機……
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